《周起元传疏辑补》是何丙仲历经两年整理完成的。他在福建省一家图书馆找到同治版的《周忠愍公传疏》和周起元自订年谱的刻本。同时又从苏州、浮梁（今江西景德镇）、南昌等府县志，以及《东林列传》《熹朝忠节死臣列传》《颂天胪笔》等东林党有关典籍，甚至从其生前好友高攀龙、刘宗周、李应升、缪昌期等东林党人的稀见著作，追索到许多有关周起元的传记和诗文、书信等，尤为值得一提的是，还首次发现著名戏剧大师汤显祖写给周起元的两篇诗文。

成书的过程中，何丙仲根据原刻五卷本的体例，扩编为传记、西台奏疏、抚吴奏疏、诗文辑佚、兰言录、崇祀录、年谱诰命共七卷，另增三个附录，一为张燮等友人所作与周起元有关的诗文和书信，二为其祖父周一阳的史料，三为“纪遗”，综合与周起元有关的点滴记载。